Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DCAF4Q8WV16 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms