Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3RF3Q8TEJ3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3RF3Q8TEJ3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms