Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHM5

KDM2B, Lysine-specific demethylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2BQ8NHM5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
KDM2BQ8NHM5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM2BQ8NHM5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM2BQ8NHM5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2BQ8NHM5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2BQ8NHM5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2BQ8NHM5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2BQ8NHM5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2BQ8NHM5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2BQ8NHM5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2BQ8NHM5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2BQ8NHM5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2BQ8NHM5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2BQ8NHM5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2BQ8NHM5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2BQ8NHM5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2BQ8NHM5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2BQ8NHM5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms