Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC00116Q8NCU8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC00116Q8NCU8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC00116Q8NCU8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC00116Q8NCU8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC00116Q8NCU8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC00116Q8NCU8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC00116Q8NCU8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC00116Q8NCU8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LINC00116Q8NCU8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LINC00116Q8NCU8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LINC00116Q8NCU8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
LINC00116Q8NCU8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LINC00116Q8NCU8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00116Q8NCU8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms