Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms