Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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LINC00612Q8N6U2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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LINC00612Q8N6U2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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LINC00612Q8N6U2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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LINC00612Q8N6U2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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LINC00612Q8N6U2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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LINC00612Q8N6U2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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LINC00612Q8N6U2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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LINC00612Q8N6U2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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