Protein–RNA interactions for Protein: Q8N394

TMTC2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2Q8N394 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMTC2Q8N394 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMTC2Q8N394 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMTC2Q8N394 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMTC2Q8N394 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMTC2Q8N394 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMTC2Q8N394 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMTC2Q8N394 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMTC2Q8N394 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMTC2Q8N394 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMTC2Q8N394 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMTC2Q8N394 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMTC2Q8N394 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMTC2Q8N394 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMTC2Q8N394 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMTC2Q8N394 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMTC2Q8N394 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMTC2Q8N394 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMTC2Q8N394 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMTC2Q8N394 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMTC2Q8N394 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMTC2Q8N394 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMTC2Q8N394 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMTC2Q8N394 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMTC2Q8N394 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMTC2Q8N394 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMTC2Q8N394 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMTC2Q8N394 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
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