Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HACE1Q8IYU2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACE1Q8IYU2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms