Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD1L3Q7Z443 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PKD1L3Q7Z443 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms