Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms