Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
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USP34Q70CQ2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
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USP34Q70CQ2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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USP34Q70CQ2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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USP34Q70CQ2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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USP34Q70CQ2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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USP34Q70CQ2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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USP34Q70CQ2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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USP34Q70CQ2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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USP34Q70CQ2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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USP34Q70CQ2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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USP34Q70CQ2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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USP34Q70CQ2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP34Q70CQ2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP34Q70CQ2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP34Q70CQ2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP34Q70CQ2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP34Q70CQ2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP34Q70CQ2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP34Q70CQ2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP34Q70CQ2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP34Q70CQ2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP34Q70CQ2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP34Q70CQ2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP34Q70CQ2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP34Q70CQ2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP34Q70CQ2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP34Q70CQ2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP34Q70CQ2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP34Q70CQ2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP34Q70CQ2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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