Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms