Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms