Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms