Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms