Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXV0

GFRAL, GDNF family receptor alpha-like, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRALQ6UXV0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRALQ6UXV0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRALQ6UXV0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRALQ6UXV0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRALQ6UXV0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRALQ6UXV0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRALQ6UXV0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRALQ6UXV0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRALQ6UXV0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRALQ6UXV0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRALQ6UXV0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRALQ6UXV0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRALQ6UXV0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRALQ6UXV0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRALQ6UXV0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRALQ6UXV0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRALQ6UXV0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRALQ6UXV0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRALQ6UXV0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms