Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms