Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms