Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF40BQ6NWY9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40BQ6NWY9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms