Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms