Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MALRD1Q5VYJ5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms