Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYTL3Q4VX76 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms