Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP13A4Q4VNC1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms