Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TTLL9Q3SXZ7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms