Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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KRTAP21-3Q3LHN1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
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