Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NBPF1Q3BBV0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms