Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
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