Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms