Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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BRD3Q15059 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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BRD3Q15059 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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BRD3Q15059 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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BRD3Q15059 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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BRD3Q15059 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
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