Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
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