Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms