Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms