Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE3BQ13370 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
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