Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.461e-6■■□□□ 13.5
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G3BP1Q13283 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.161e-6■■□□□ 13.5
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G3BP1Q13283 PSMA7-206ENST00000486193 548 ntTSL 25.33□□□□□ -1.564e-6■■□□□ 13.5
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G3BP1Q13283 GPS1-210ENST00000580141 924 ntTSL 519.29■□□□□ 0.682e-6■■□□□ 13.5
G3BP1Q13283 FLNA-211ENST00000465144 398 ntTSL 222.3■■□□□ 1.164e-11■■□□□ 13.5
G3BP1Q13283 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.838e-10■■□□□ 13.5
G3BP1Q13283 SPTAN1-229ENST00000636010 1472 ntTSL 514.3□□□□□ -0.125e-7■■□□□ 13.5
G3BP1Q13283 SPTAN1-221ENST00000630763 1503 ntTSL 211.83□□□□□ -0.525e-7■■□□□ 13.5
G3BP1Q13283 NBR1-203ENST00000585505 3295 ntTSL 29.78□□□□□ -0.844e-9■■□□□ 13.4
G3BP1Q13283 DBN1-205ENST00000471767 428 ntTSL 521.48■■□□□ 1.033e-8■■□□□ 13.4
G3BP1Q13283 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.918e-7■■□□□ 13.4
G3BP1Q13283 AP2B1-213ENST00000612116 3483 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.948e-7■■□□□ 13.4
G3BP1Q13283 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.978e-7■■□□□ 13.4
G3BP1Q13283 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.128e-7■■□□□ 13.4
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