Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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