Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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