Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 FAR7YFR008W 666 nt2.88□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YGR053CYGR053C 852 nt2.88□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 TCD1YHR003C 1290 nt2.88□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YIL012WYIL012W 342 nt2.88□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 CKA1YIL035C 1119 nt2.88□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 SFT1YKL006C-A 294 nt2.88□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.88□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YAP7YOL028C 738 nt2.88□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 MIX23YBL107C 591 nt2.88□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 PIS1YPR113W 663 nt2.88□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 TFB1YDR311W 1929 nt2.87□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YKR078WYKR078W 1758 nt2.87□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 UTP14YML093W 2700 nt2.87□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 BOI1YBL085W 2943 nt2.87□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 SUL1YBR294W 2580 nt2.87□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 SCY1YGL083W 2415 nt2.87□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 KEL2YGR238C 2649 nt2.87□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YDR018CYDR018C 1191 nt2.87□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 OCA6YDR067C 675 nt2.87□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 FIN1YDR130C 876 nt2.87□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YHL005CYHL005C 393 nt2.87□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt2.87□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 GPI14YJR013W 1212 nt2.87□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 RRT16YNL105W 429 nt2.87□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 ATG3YNR007C 933 nt2.87□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 HEM4YOR278W 828 nt2.87□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YOR331CYOR331C 558 nt2.87□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 RTT10YPL183C 3042 nt2.87□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YER138CYER138C 5268 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YER160CYER160C 5268 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YJR027WYJR027W 5268 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YML039WYML039W 5268 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YML045WYML045W 5268 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YMR050CYMR050C 5268 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YOR296WYOR296W 3870 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YME2YMR302C 2553 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 NCS2YNL119W 1482 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 SSP1YHR184W 1716 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 HYP2YEL034W 474 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 VMA21YGR105W 234 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 COG2YGR120C 789 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 RPL14BYHL001W 417 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 COX8YLR395C 237 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 AIM36YMR157C 768 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 HEH2YDR458C 1992 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 GYP7YDL234C 2241 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 FAA2YER015W 2235 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 RPN3YER021W 1572 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 KAR9YPL269W 1935 nt2.85□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 HPA3YEL066W 540 nt2.85□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 RSR1YGR152C 819 nt2.85□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 SDL1YIL167W 633 nt2.85□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 GMC2YLR445W 567 nt2.85□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 NCB2YDR397C 441 nt2.84□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 RPL23BYER117W 414 nt2.84□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YAP5YIR018W 738 nt2.84□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YJL086CYJL086C 369 nt2.84□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 PDP3YLR455W 915 nt2.84□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 ATP18YML081C-A 180 nt2.84□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 CSI1YMR025W 888 nt2.84□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YNL150WYNL150W 408 nt2.84□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 YPR014CYPR014C 330 nt2.84□□□□□ -1.95
SEC39Q12745 NEL1YHR035W 1893 nt2.84□□□□□ -1.96
SEC39Q12745 NMA111YNL123W 2994 nt2.83□□□□□ -1.96
SEC39Q12745 YEL1YBL060W 2064 nt2.83□□□□□ -1.96
SEC39Q12745 AI2Q0055 2565 nt2.83□□□□□ -1.96
SEC39Q12745 CWC22YGR278W 1734 nt2.83□□□□□ -1.96
SEC39Q12745 ALY1YKR021W 2748 nt2.83□□□□□ -1.96
SEC39Q12745 YIL080WYIL080W 4722 nt2.83□□□□□ -1.96
SEC39Q12745 snR59snR59 78 nt2.83□□□□□ -1.96
SEC39Q12745 ACF4YJR083C 930 nt2.83□□□□□ -1.96
SEC39Q12745 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt2.83□□□□□ -1.96
SEC39Q12745 MSN1YOL116W 1149 nt2.83□□□□□ -1.96
SEC39Q12745 HSP10YOR020C 321 nt2.83□□□□□ -1.96
SEC39Q12745 SEN54YPL083C 1404 nt2.83□□□□□ -1.96
SEC39Q12745 AXL1YPR122W 3627 nt2.82□□□□□ -1.96
SEC39Q12745 BUB1YGR188C 3066 nt2.82□□□□□ -1.96
SEC39Q12745 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
SEC39Q12745 CYR1YJL005W 6081 nt2.82□□□□□ -1.96
SEC39Q12745 YDR029WYDR029W 315 nt2.82□□□□□ -1.96
SEC39Q12745 EMC4YGL231C 573 nt2.82□□□□□ -1.96
SEC39Q12745 BUD19YJL188C 309 nt2.82□□□□□ -1.96
SEC39Q12745 YLR224WYLR224W 1110 nt2.82□□□□□ -1.96
SEC39Q12745 RIM9YMR063W 720 nt2.82□□□□□ -1.96
SEC39Q12745 YOL057WYOL057W 2136 nt2.82□□□□□ -1.96
SEC39Q12745 SFM1YOR021C 642 nt2.82□□□□□ -1.96
SEC39Q12745 ROG1YGL144C 2058 nt2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.3 ms