Protein–RNA interactions for Protein: Q12468

RRI1, COP9 signalosome complex subunit 5, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRI1Q12468 RNH203YLR154C 333 nt2.99□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 RPS28BYLR264W 204 nt2.99□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 ILV5YLR355C 1188 nt2.99□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 YML003WYML003W 873 nt2.99□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 YBL071CYBL071C 309 nt2.99□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt2.99□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 YPL142CYPL142C 318 nt2.99□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 YBR209WYBR209W 318 nt2.99□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 GPX2YBR244W 489 nt2.99□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 MAL33YBR297W 1407 nt2.99□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 CDC55YGL190C 1581 nt2.99□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 YHR080CYHR080C 4038 nt2.99□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 HBT1YDL223C 3141 nt2.99□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 RTR2YDR066C 591 nt2.98□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 YGR242WYGR242W 309 nt2.98□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 RRF1YHR038W 693 nt2.98□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 SDP1YIL113W 630 nt2.98□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 YJR011CYJR011C 786 nt2.98□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 ADI1YMR009W 540 nt2.98□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 NOP15YNL110C 663 nt2.98□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.98□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 NGL1YOL042W 1092 nt2.98□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 YPL034WYPL034W 498 nt2.98□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 ARR2YPR200C 393 nt2.98□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 VID24YBR105C 1089 nt2.98□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 SPE1YKL184W 1401 nt2.98□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 STU2YLR045C 2667 nt2.98□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 YSP2YDR326C 4317 nt2.98□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 CSR2YPR030W 3366 nt2.98□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 SSF2YDR312W 1362 nt2.98□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 TCP1YDR212W 1680 nt2.98□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 SIZ1YDR409W 2715 nt2.98□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 NUP60YAR002W 1620 nt2.97□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 MSH4YFL003C 2637 nt2.97□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 EMP70YLR083C 2004 nt2.97□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.97□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 YGL042CYGL042C 306 nt2.97□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 ARV1YLR242C 966 nt2.97□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 PKR1YMR123W 369 nt2.97□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 HHF2YNL030W 312 nt2.97□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 YOR053WYOR053W 342 nt2.97□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 YBR285WYBR285W 435 nt2.97□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 POL2YNL262W 6669 nt2.97□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 CBP2YHL038C 1893 nt2.96□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 AKR1YDR264C 2295 nt2.96□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 VAC8YEL013W 1737 nt2.96□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.96□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.96□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.96□□□□□ -1.93
RRI1Q12468 DAS1YJL149W 1992 nt2.96□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 RPA135YPR010C 3612 nt2.96□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 YCR090CYCR090C 549 nt2.96□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 MTC3YGL226W 372 nt2.96□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 YAL037WYAL037W 804 nt2.96□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 RRD2YPL152W 1077 nt2.96□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 MPS1YDL028C 2295 nt2.96□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 FLO5YHR211W 3228 nt2.96□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 FRE8YLR047C 2061 nt2.96□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 SEC15YGL233W 2733 nt2.95□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 BUD4YJR092W 4344 nt2.95□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 YDR133CYDR133C 336 nt2.95□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 AIM11YER093C-A 414 nt2.95□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 RTT105YER104W 627 nt2.95□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 OTU2YHL013C 924 nt2.95□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 CRG1YHR209W 876 nt2.95□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 SPC1YJR010C-A 285 nt2.95□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 RPL15AYLR029C 615 nt2.95□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.95□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.95□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.95□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.95□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 SEC22YLR268W 645 nt2.95□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 YLR269CYLR269C 351 nt2.95□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 YLR287CYLR287C 1068 nt2.95□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 YOR392WYOR392W 444 nt2.95□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 ROM1YGR070W 3468 nt2.95□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 RED1YLR263W 2484 nt2.95□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 CIN1YOR349W 3045 nt2.94□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 YER068C-AYER068C-A 432 nt2.94□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.94□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.94□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 YPR053CYPR053C 456 nt2.94□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 RPA190YOR341W 4995 nt2.94□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 DOA4YDR069C 2781 nt2.94□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 YCK2YNL154C 1641 nt2.93□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 YEL1YBL060W 2064 nt2.93□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 SNQ2YDR011W 4506 nt2.93□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 TCD1YHR003C 1290 nt2.93□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 YMR141CYMR141C 309 nt2.93□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 SSN8YNL025C 972 nt2.93□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 ICR1ICR1 3199 nt2.93□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 HOP1YIL072W 1818 nt2.93□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 YDL180WYDL180W 1644 nt2.93□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.93□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 REG1YDR028C 3045 nt2.93□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 SRB4YER022W 2064 nt2.92□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 CWH41YGL027C 2502 nt2.92□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 MAK21YDR060W 3078 nt2.92□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 MDV1YJL112W 2145 nt2.92□□□□□ -1.94
RRI1Q12468 SNT1YCR033W 3681 nt2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.8 ms