Protein–RNA interactions for Protein: Q12242

RUP1, UBA domain-containing protein RUP1, yeastyeast

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RUP1Q12242 NAB3YPL190C 2409 nt2.61□□□□□ -1.99
RUP1Q12242 YDR338CYDR338C 2088 nt2.61□□□□□ -1.99
RUP1Q12242 YDL032WYDL032W 312 nt2.61□□□□□ -1.99
RUP1Q12242 YHR213WYHR213W 597 nt2.61□□□□□ -1.99
RUP1Q12242 YAR062WYAR062W 597 nt2.61□□□□□ -1.99
RUP1Q12242 KTI11YBL071W-A 249 nt2.61□□□□□ -1.99
RUP1Q12242 UBX3YDL091C 1368 nt2.61□□□□□ -1.99
RUP1Q12242 CTF13YMR094W 1437 nt2.6□□□□□ -1.99
RUP1Q12242 snR5snR5 204 nt2.6□□□□□ -1.99
RUP1Q12242 AIM19YIL087C 474 nt2.6□□□□□ -1.99
RUP1Q12242 YKL123WYKL123W 381 nt2.6□□□□□ -1.99
RUP1Q12242 YOR331CYOR331C 558 nt2.6□□□□□ -1.99
RUP1Q12242 YPR203WYPR203W 309 nt2.6□□□□□ -1.99
RUP1Q12242 YOL057WYOL057W 2136 nt2.6□□□□□ -1.99
RUP1Q12242 TCB2YNL087W 3537 nt2.6□□□□□ -1.99
RUP1Q12242 PSY2YNL201C 2577 nt2.59□□□□□ -1.99
RUP1Q12242 YDR115WYDR115W 318 nt2.59□□□□□ -1.99
RUP1Q12242 AIM18YHR198C 966 nt2.59□□□□□ -1.99
RUP1Q12242 YJL119CYJL119C 324 nt2.59□□□□□ -1.99
RUP1Q12242 YAL037WYAL037W 804 nt2.59□□□□□ -1.99
RUP1Q12242 COX8YLR395C 237 nt2.59□□□□□ -1.99
RUP1Q12242 YPR170CYPR170C 336 nt2.59□□□□□ -1.99
RUP1Q12242 snR191snR191 274 nt2.59□□□□□ -1.99
RUP1Q12242 SSP1YHR184W 1716 nt2.59□□□□□ -2
RUP1Q12242 SEN54YPL083C 1404 nt2.59□□□□□ -2
RUP1Q12242 YLR108CYLR108C 1458 nt2.58□□□□□ -2
RUP1Q12242 NCS2YNL119W 1482 nt2.58□□□□□ -2
RUP1Q12242 MLH1YMR167W 2310 nt2.58□□□□□ -2
RUP1Q12242 YDR042CYDR042C 603 nt2.58□□□□□ -2
RUP1Q12242 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.58□□□□□ -2
RUP1Q12242 YMR254CYMR254C 309 nt2.58□□□□□ -2
RUP1Q12242 RRT16YNL105W 429 nt2.58□□□□□ -2
RUP1Q12242 ARL3YPL051W 597 nt2.58□□□□□ -2
RUP1Q12242 YCL007CYCL007C 393 nt2.58□□□□□ -2
RUP1Q12242 YLR446WYLR446W 1302 nt2.58□□□□□ -2
RUP1Q12242 ESL2YKR096W 3588 nt2.58□□□□□ -2
RUP1Q12242 ALY1YKR021W 2748 nt2.58□□□□□ -2
RUP1Q12242 ARP8YOR141C 2646 nt2.57□□□□□ -2
RUP1Q12242 YHR078WYHR078W 1659 nt2.57□□□□□ -2
RUP1Q12242 YIL080WYIL080W 4722 nt2.57□□□□□ -2
RUP1Q12242 ERG28YER044C 447 nt2.57□□□□□ -2
RUP1Q12242 RTS3YGR161C 792 nt2.57□□□□□ -2
RUP1Q12242 GPI14YJR013W 1212 nt2.57□□□□□ -2
RUP1Q12242 VPS63YLR261C 327 nt2.57□□□□□ -2
RUP1Q12242 PDP3YLR455W 915 nt2.57□□□□□ -2
RUP1Q12242 RPO41YFL036W 4056 nt2.57□□□□□ -2
RUP1Q12242 YEL1YBL060W 2064 nt2.57□□□□□ -2
RUP1Q12242 SWC4YGR002C 1431 nt2.57□□□□□ -2
RUP1Q12242 SPF1YEL031W 3648 nt2.56□□□□□ -2
RUP1Q12242 YPL150WYPL150W 2706 nt2.56□□□□□ -2
RUP1Q12242 PBS2YJL128C 2007 nt2.56□□□□□ -2
RUP1Q12242 TRZ1YKR079C 2517 nt2.56□□□□□ -2
RUP1Q12242 APC11YDL008W 498 nt2.56□□□□□ -2
RUP1Q12242 FIN1YDR130C 876 nt2.56□□□□□ -2
RUP1Q12242 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt2.56□□□□□ -2
RUP1Q12242 TDA2YER071C 381 nt2.56□□□□□ -2
RUP1Q12242 MRP49YKL167C 414 nt2.56□□□□□ -2
RUP1Q12242 PRE8YML092C 753 nt2.56□□□□□ -2
RUP1Q12242 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.56□□□□□ -2
RUP1Q12242 HSP10YOR020C 321 nt2.56□□□□□ -2
RUP1Q12242 YPR147CYPR147C 915 nt2.56□□□□□ -2
RUP1Q12242 MUD1YBR119W 897 nt2.56□□□□□ -2
RUP1Q12242 VPS64YDR200C 1815 nt2.56□□□□□ -2
RUP1Q12242 SEC26YDR238C 2922 nt2.55□□□□□ -2
RUP1Q12242 SCY1YGL083W 2415 nt2.55□□□□□ -2
RUP1Q12242 VHR1YIL056W 1923 nt2.55□□□□□ -2
RUP1Q12242 JSN1YJR091C 3276 nt2.55□□□□□ -2
RUP1Q12242 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.55□□□□□ -2
RUP1Q12242 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt2.55□□□□□ -2
RUP1Q12242 NMA111YNL123W 2994 nt2.55□□□□□ -2
RUP1Q12242 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.55□□□□□ -2
RUP1Q12242 SGT1YOR057W 1188 nt2.55□□□□□ -2
RUP1Q12242 BFR1YOR198C 1413 nt2.55□□□□□ -2
RUP1Q12242 SKT5YBL061C 2091 nt2.54□□□□□ -2
RUP1Q12242 MFB1YDR219C 1398 nt2.54□□□□□ -2
RUP1Q12242 HPA3YEL066W 540 nt2.54□□□□□ -2
RUP1Q12242 IRC21YMR073C 606 nt2.54□□□□□ -2
RUP1Q12242 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.54□□□□□ -2
RUP1Q12242 VAC8YEL013W 1737 nt2.54□□□□□ -2
RUP1Q12242 CAF120YNL278W 3183 nt2.53□□□□□ -2
RUP1Q12242 GEA1YJR031C 4227 nt2.53□□□□□ -2
RUP1Q12242 NCB2YDR397C 441 nt2.53□□□□□ -2
RUP1Q12242 YGR226CYGR226C 210 nt2.53□□□□□ -2
RUP1Q12242 PRP21YJL203W 843 nt2.53□□□□□ -2
RUP1Q12242 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.53□□□□□ -2
RUP1Q12242 YLR224WYLR224W 1110 nt2.53□□□□□ -2
RUP1Q12242 YOR169CYOR169C 465 nt2.53□□□□□ -2
RUP1Q12242 TAZ1YPR140W 1146 nt2.53□□□□□ -2
RUP1Q12242 ICR1ICR1 3199 nt2.53□□□□□ -2.01
RUP1Q12242 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt2.52□□□□□ -2.01
RUP1Q12242 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt2.52□□□□□ -2.01
RUP1Q12242 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt2.52□□□□□ -2.01
RUP1Q12242 YCL020WYCL020W 1317 nt2.52□□□□□ -2.01
RUP1Q12242 snR59snR59 78 nt2.52□□□□□ -2.01
RUP1Q12242 YDR018CYDR018C 1191 nt2.52□□□□□ -2.01
RUP1Q12242 FAR7YFR008W 666 nt2.52□□□□□ -2.01
RUP1Q12242 SDL1YIL167W 633 nt2.52□□□□□ -2.01
RUP1Q12242 YAP5YIR018W 738 nt2.52□□□□□ -2.01
RUP1Q12242 YJR087WYJR087W 351 nt2.52□□□□□ -2.01
RUP1Q12242 YKL066WYKL066W 444 nt2.52□□□□□ -2.01
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