Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUDPQ08623 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms