Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms