Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms