Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms