Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms