Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms