Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLOD1Q02809 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms