Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms