Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms