Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms