Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RPS29P62273 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RPS29P62273 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RPS29P62273 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
RPS29P62273 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RPS29P62273 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RPS29P62273 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RPS29P62273 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RPS29P62273 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RPS29P62273 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RPS29P62273 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RPS29P62273 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RPS29P62273 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RPS29P62273 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RPS29P62273 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RPS29P62273 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RPS29P62273 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RPS29P62273 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RPS29P62273 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RPS29P62273 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RPS29P62273 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RPS29P62273 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RPS29P62273 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RPS29P62273 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RPS29P62273 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RPS29P62273 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RPS29P62273 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RPS29P62273 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RPS29P62273 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RPS29P62273 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RPS29P62273 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RPS29P62273 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RPS29P62273 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS29P62273 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS29P62273 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS29P62273 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS29P62273 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS29P62273 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS29P62273 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS29P62273 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS29P62273 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS29P62273 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS29P62273 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS29P62273 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS29P62273 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS29P62273 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS29P62273 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS29P62273 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS29P62273 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS29P62273 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS29P62273 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS29P62273 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS29P62273 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS29P62273 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS29P62273 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS29P62273 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS29P62273 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS29P62273 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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